Más sencillo (y perdón por el doble post, jodido móvil...) los PMAG están específicamente diseñados para las plataformas AR-15(M4)/M16/ACR por el diseño del recibidor del cargador de estos. Tanto en la realidad como en el airsoft no vas a tener apenas problemas en usarlos en cualquier M4/M16. Pero pero hay ciertos modelos (tanto en la realidad como en el airsoft) como el que he citado antes, el HK416 como otros que usen también cargadores tipo STANAG (los de M4/M16 de toda la vida vamos), en los que los PMAG no valdrían debido a su diseño.
Para esos otros existen los EMAG.
Asi que básicamente, en airsoft, como ya te han indicado la diferencia es principalmente estética o de diseño en ciertos casos.
Luego como también te han comentado, existe diferencia de precio, calidad y capacidad según el fabricante de dichos cargadores Magpul, por eso sería útil que pusieras algún enlace donde los hayas visto para poder indicarte
